Hola Joris, bonita moneda!
Es correcta tu catalogación: "se trata se cuatro maravedís, a nombre de los Reyes Católicos, de la ceca de Cuenca."
Solo añadir que el ensayador es Pedro Román que trabajó en esta ceca entre 1558 y 1566.
Se trataría de la B-303 del catálogo de Tosiriano.
Aquí tienes la ficha de una igual:
http://www.wikimoneda.com/fiche.php?id=6746
En cuanto al extraño relieve, parece un repinte.
Saludos.