Hola, son dos cuartos -dos maravedís de Felipe II de Cuenca, como los que has puesto antes (los he pasado a la sección de modernas)
No es una flor, es una granada y efectivamente, unas veces va arriba, otras delante y otras debajo.
Supongo que sería una marca de emisión, es decir como se labraron durante varios años, quizás la posición de la granada marque las remesas acuñadas en una tirada determinada.
Saludos.